У меня была похожая ситуация. Оказалось, что датчик температуры сместился во время заливки стяжки и попал в зону с более высокой температурой. Из-за этого терморегулятор раньше отключал систему, и часть комнаты не успевала прогреться. Пригласил мастера с тепловизором, он быстро определил проблему. Пришлось вскрывать небольшой участок стяжки, переставить датчик в правильное место и заново залить. После этого все заработало как надо. Еще один важный момент - проверьте качество теплоизоляции под системой, если она где-то повреждена, тепло может уходить вниз неравномерно. Кстати, когда покупал систему на Leto.net.ua, там давали подробную инструкцию по правильной установке датчика, жаль, что монтажники ее проигнорировали. Теперь всегда контролирую такие моменты лично при установке любого оборудования.